話說鴨川這條自古與京都市民生活息息相關的河川過去並不安分，而古代防洪技術並不發達，一但遇到豪雨鴨川氾濫必然造成重大傷亡，在平安初期還設置「防鴨河使」進行鴨川沿岸的堤防建造與管理。鎌倉時期某次鴨川氾濫，當時擔任「防鴨河使」的中原為兼向地藏祈求雨停爾後靈驗而避免了洪害(一說是地藏神託才避免了洪害)，為感謝地藏的恩德故將地藏尊供奉於此，並將之稱為「雨止地藏」。仲源寺雨止地藏的傳說還有另一個版本，即連續幾天的暴雨使鴨川潰堤，當時有人發現地藏出現在鴨川裡面救助溺水的人。不過這應該叫「撈人地藏」或「救溺地藏」比較合理吧？

另外，仲源寺的名稱與中原為兼有關，不論傳說中是他向地藏祈求雨停或是地藏托夢告訴他鴨川會氾濫，他都扮演重要的角色，因此寺名取其姓「中原」在「中」旁邊加上人字旁，在「原」字旁邊加上水字邊，象徵人和水相安。

而「雨止地藏」還有另外兩個名字「目疾地藏」以及「哭泣地藏」，這兩個名字都和一對老夫妻有關係…

室町時期有一對虔誠敬拜地藏的老夫妻，後來老先生得了眼疾失明，老太太竟對地藏發牢騷，沒想到因此得到神諭，要他們拿寺內的閼伽水回家洗眼睛，洗完眼睛後的老先生就重見光明了，當他們回到這裡還願（道歉？）時，竟然發現地藏的右眼變紅還流下眼淚！原來是地藏代為受苦啊！因此又稱為「哭泣地藏」，至今地藏尊的右眼仍是紅色的，前往參拜時一定要仔細觀察一下。就這樣「雨止地藏」成了「目疾地藏」，另一個說法則是「雨止」（AMEYAMI）和「目疾」（MEYAMI）發音很像，久而久之訛傳變異就變目疾地藏了，嗯，果然還是傳說的情節比較動人啊。

仲源寺還有個趣聞，如果前往八坂神社參拜時遇到下雨，只要來仲源寺躲雨沒多久雨就會停了喔。